中药材一般不能清洗的。但如果泥沙杂质太多的话，可以手工挑拣干净后再泡酒（中药粉末除外）。清水浸泡会随水流失好多有用的成份的，而且会因为水价太多导致药酒变质。
不知道你用的是什么类型的粉碎机，一般来说是可以用水洗的，如果害怕用水洗过之后生锈可以用纯度高一点的乙醇再清洗一遍
